九江市農(nóng)業(yè)科學(xué)院于12月24日宣布,聯(lián)合中山大學(xué)和江西省瑞昌長(zhǎng)江四大家魚(yú)原種場(chǎng),首次完成并發(fā)布了長(zhǎng)江流域極危物種“鳤”的高質(zhì)量染色體水平基因組。這一突破性成果為鳤的保護(hù)工作提供了重要的科學(xué)依據(jù)。
鳤曾是我國(guó)重要的淡水經(jīng)濟(jì)魚(yú)類(lèi),廣泛分布于長(zhǎng)江流域。然而,由于環(huán)境惡化和人類(lèi)活動(dòng)的影響,其數(shù)量急劇下降,被列為極危物種。2020年12月,在長(zhǎng)江公安江段監(jiān)測(cè)到了7尾鳤,這是近年來(lái)野外調(diào)查發(fā)現(xiàn)最多的一次,凸顯了保護(hù)工作的緊迫性。
鳤基因組信息的缺乏一直是保護(hù)工作的重大障礙。研究團(tuán)隊(duì)利用PacBio和Hi-C測(cè)序數(shù)據(jù),成功組裝了鳤染色體級(jí)別的基因組,大小為883.1 Mb,包含24條假染色體,Scaffold N50長(zhǎng)度為35.1 Mb。通過(guò)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù),團(tuán)隊(duì)預(yù)測(cè)了28674個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因,并將組裝和注釋數(shù)據(jù)公布到GenBank和Figshare數(shù)據(jù)庫(kù)。
論文共同通訊作者盧建國(guó)表示:“鳤基因組信息的首次發(fā)布對(duì)于理解其遺傳多樣性、識(shí)別獨(dú)特適應(yīng)性以及制定有效的保護(hù)策略至關(guān)重要?!边@一成果不僅為鳤的保護(hù)提供了科學(xué)依據(jù),也為其他瀕危物種的基因組研究提供了重要參考。